Coccidiosen ska vad jag vet inte vara något problem, den är artspecifik, så har hönsen coccidios så smittar inte den till kaninen. Kaniner smittas bara av kaniner.
Risken för salmonella hos kaninen ökar lite om man har dem tillsammans med hönsen, men kaniner blir vad jag vet oftast inte sjuka av salmonella, det är bara om man ska äta kaninen som det spelar roll.
Oväsen och damm är största problemen med att ha höns och kaniner tillsammans. Men är de i olika rum så ska det inte vara så stort problem.