Det här kan antingen vara rejält komplicerat eller annars bara en fråga om urvädring.
Är det så att luktar mögel (eller är det ruttet trä, det doftar?) så finns risken att det rör sig om en större skada, vanligen i undergolvet eller värre de nedre syllarna. I sådant fall måste det hela lokaliseras. Kräver en hel del arbete och pengar, lite beroende på hur händig du är själv.
Är det bara så att det är en lukt som kommer sig av att huset varit tillstängt en längre tid så räcker det förmodligen med vädring. Å andra sidan brukar gamla hus ha självdrag... Hur är det ställt med ventilationen, undrar också jag?
Hur som helst måste orsaken till det hela lokaliseras. Jag hoppas att du har tur och att det hela rör sig om "doft" som du skriver och inte "lukt".
Lycka till!