Kan den där isoleringen helt enkelt vara halvruttet och hopbakat sågspån eller liknande?
Jag skulle nog vilja säga att den där typen av "överraskningar" nästan hör till när man har med gamla timmerhus att göra, i synnerhet om marken är fuktig runt huset eller om marknivån har ökat med tiden så att understa stockvarvet inte når upp så långt över matjord och växtlighet som det var tänkt från början.
Det är ganska talande att det understa stockvarvet förr i tiden kallades "rötsyllen" i en del delar av Sverige, man var från början inställd på att den har begränsad livslängd och måste bytas då och då.
Jag skulle föreslå att du gör följande undersökningar:
1) Kolla om understa stocken är dålig runt hela huset, eller om skadan är koncentrerad till en vägg.
2) Kolla om det finns tecken på att golvbjälkarna är dåliga i närheten av skadan (t ex om golvet sviktar).
3) Ta dig in i krypgrunden och besiktiga trossbotten underifrån. Om det är så trångt att det inte går att krypa under trossbotten, eller om den delvis har rasat ner på marken, så får man rikta in sig på att bryta upp golv för att komma åt att åtgärda det.