Jag skulle tro att skinnet har blivit dåligt.
Har det varit ute flera dygn i plusgrader så har det nog börjat ruttna. De där bruna fläckarna låter som att det har gjort de.
Jag skulle även tipsa om att fettgarva skinnet i stället för alun. Om ett alungarvat skinn blir blött så måste det garvas om, vad jag har förstått, ett fettgarvat skinn blir bara stelt och måste mjukgöras igen....bara och bara, men men. Men om man även rökgarvar det fettgarvade skinnet så tål det att bli blött utan att bli stelt.
Har själv aldrig gjort ett koskinn och kan tänka mig att det är ett sjuihelsike jobb att mjukgöra. Skulle tippa på att spännram är det bästa sättet.
När man har blött upp ett torkat skinn så bör det skrapas så fort som möjligt och sen garvas. Vet inte hur lång tid man har på sig innan det ruttnar men det kan nog gå på några dagar. Kvalificerade gissningar

Jag brukar i alla fall skrapa skinnet och garva det samma dag. Dock har jag inte garvat större skinn än get- och fårskinn.
Lycka till, Micke.