Epoxi på betong kan spricka/lossna, även om det nog är ett av de bättre alternativen. Skulle jag bygga något dylikt skulle jag undersöka om det är ok med diamantslipad betong. Om jag förstått det rätt så impregnerar man sedan betongen med vattenglas för att få en hårdare yta. Se exempelvis:
http://www.arildsallteknik.se/index.php?option=com_content&task=view&id=7&Itemid=17När det gäller golvvärmen så tror jag knappast det är ett problem med ljumna golv och lukt av sur mjölk. Om mjölkspill etc blir kvar så länge har/får ni nog andra problem att brottas med.
Jag gissar att ni kommer att ha kyltank ock liknande för mjölken. Liksom vid kylning av komjölk bör man med fördel kunna återvinna energin från mjölkkylningen för vv-produktion/värme. Ju lägre temperaturkrav för värmen dess bättre återvinningsekonomi brukar det generellt vara. Golvvärme arbetar med mycket låga vattentemperaturer.
Kul projekt föresten!