Jag skulle nog gissa på lagerljud. Om det är ett skadat kugghjul som låter, så brukar ljudet ändra sig kraftigt när man kör på den växel där det kugghjulet belastas. Dessutom brukar ljudet ändra sig och eventuellt försvinna helt och hållet vid motorbromsning i det fallet.
Man kan dra vissa slutsatser om vilket lager det är genom att köra på olika växlar och höra efter om ljudets karaktär följer traktorns hastighet eller motorvarvtalet.
Det kan vara värt att prova att byta olja i växellådan och se om man får en tydlig förbättring, innan man lägger ner en massa arbete eller pengar på att riva den.